Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SftpdP50404 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SftpdP50404 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms