Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc13P50207 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms