Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1cP49919 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1cP49919 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1cP49919 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1cP49919 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1cP49919 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1cP49919 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1cP49919 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1cP49919 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1cP49919 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1cP49919 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1cP49919 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1cP49919 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1cP49919 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms