Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PtpreP49446 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PtpreP49446 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PtpreP49446 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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PtpreP49446 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PtpreP49446 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PtpreP49446 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtpreP49446 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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