Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CitP49025 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CitP49025 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CitP49025 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms