Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca1P48754 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms