Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VdrP48281 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VdrP48281 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VdrP48281 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VdrP48281 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VdrP48281 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VdrP48281 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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VdrP48281 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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VdrP48281 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VdrP48281 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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