Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Epb41P48193 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41P48193 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Epb41P48193 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms