Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gbx2P48031 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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