Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl13P47963 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms