Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Tnfsf9P41274 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms