Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
VhlP40338 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VhlP40338 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VhlP40338 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VhlP40338 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms