Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf1P39428 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms