Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprkP35822 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PtprkP35822 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PtprkP35822 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms