Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab23P35288 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab23P35288 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms