Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nedd1P33215 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nedd1P33215 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms