Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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