Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc10P31257 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms