Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprmP28828 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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