Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defa2P28309 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defa2P28309 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defa2P28309 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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