Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gjb1P28230 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms