Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctnna1P26231 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms