Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RdxP26043 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RdxP26043 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RdxP26043 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RdxP26043 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RdxP26043 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RdxP26043 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RdxP26043 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RdxP26043 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RdxP26043 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RdxP26043 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RdxP26043 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RdxP26043 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RdxP26043 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RdxP26043 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms