Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmo2P25801 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmo2P25801 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo2P25801 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms