Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdk11bP24788 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms