Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd247P24161 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 554 ms