Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd12P23812 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd12P23812 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms