Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pde6bP23440 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pde6bP23440 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6bP23440 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6bP23440 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Pde6bP23440 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pde6bP23440 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Pde6bP23440 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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