Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PparaP23204 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PparaP23204 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PparaP23204 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PparaP23204 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms