Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RarbP22605 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RarbP22605 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RarbP22605 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RarbP22605 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RarbP22605 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms