Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tpm3P21107 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms