Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Fcer1aP20489 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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