Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdgfaP20033 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PdgfaP20033 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms