Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RargP18911 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RargP18911 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RargP18911 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RargP18911 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RargP18911 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RargP18911 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RargP18911 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RargP18911 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RargP18911 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RargP18911 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RargP18911 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RargP18911 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RargP18911 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms