Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtpraP18052 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PtpraP18052 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PtpraP18052 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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