Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ass1P16460 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms