Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms