Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf1P15314 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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