Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmnb1P14733 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmnb1P14733 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms