Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb2P13373 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms