Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc6P10629 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc6P10629 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms