Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd4P10628 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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