Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
P10404 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
P10404 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
P10404 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
P10404 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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