Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01738 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01738 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01738 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01738 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01738 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01738 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01738 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01738 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01738 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01738 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01738 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01738 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01738 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01738 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01738 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01738 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01738 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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