Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifnb1P01575 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms