Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ccl20O89093 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl20O89093 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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