Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tom1O88746 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tom1O88746 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tom1O88746 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tom1O88746 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Tom1O88746 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tom1O88746 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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