Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cfdp1O88271 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms