Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcn4O70507 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms