Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms